Nizamiye Medresesi'nin Kuruluş Amaçları:

1- Sünni düşüncesinin şii Fatimilere karşı mücadelesinin kazanılmasını sağlamak bu amaçla âlimler yetiştirmek.
2- Genişleyen devlet için devlet adamları ve memurlar yetiştirmek.
3- Din adamları yetiştirerek insanlara dinin doğru öğretilmesini sağlamak. (İslamiyeti yeni benimsemiş Oğuz topluluklarının yeni inançlarının pekiştirilmesi,eskilerinin silinme gereğinin duyulması)
4- Yoksul ve zeki öğrencilere yardım ederek, yetiştirilmelerini sağlamak.
5- Dini bilimlerle birlikte pozitif bilimler okutmak ve ülkenin bilim ve teknik olarak gelişmesini sağlamak.
6- Bilginleri bir görev ve maaşla medreselere bağlayıp denetimde tutmak,devlete karşı gizli hareketlere katılmalarını önlemek.